甲鱼温室养殖成功的关键在于把节能降耗、成本控制的管理观念融入到日常管理中，这是取得较好经济效益的基础。因此，甲鱼温室养殖日常管理应围绕水温控制、饲料投喂、水质调控、病害控制四个关键环节开展工作。定期排污是控制水质的有效手段，换水是调节水质最直接的方式，换水时应根据水质情况决定换水量 。要保证充氧设施的畅通。但要选择在固定的时间段内充氧，使甲鱼形成习惯，减少充氧对甲鱼的惊扰。
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