多数基因在序列的某个碱基上会跟同种群的其他个体有区别，但是这种不同不会造成疾病或者伤害，则这个碱基的变异会在种群中传递，当这个变异有利于个体的生存时，这个变异在种群中的比例会大大增加，此变异碱基成为多态性变异，这个碱基位点称为多态性位点
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