法院办理的是诉讼离婚，协议离婚要到婚姻登记机关办理，程序如下：
1、双方到一方户口所在地的婚姻登记管理机关申请离婚登记；
2、婚姻登记机关审查双方是否是合法夫妻，对子女抚养问题的处理以及对财产的分割等问题；
3、经审查符合离婚条件的，发给离婚证并注销结婚证。
【法律依据】
《婚姻法》第31条，男女双方自愿离婚的，准予离婚。双方必须到婚姻登记机关申请离婚。
婚姻登记机关查明双方确实是自愿并对子女和财产问题已有适当处理时，发给离婚证。
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